BA l Bahia
Efetivo (CLT)
Biólogo
Biomédico
Biotecnologista
Tecnologia da Informação
Responsabilidades
- Apoio no desenho e implementação de pipelines de bioinformática: Colaborar no desenvolvimento e na execução de pipelines reprodutíveis (pré-processamento, alinhamento, chamadas de variantes), utilizando containers e aprendendo melhores práticas internacionais (GATK Best Practices, nf-core), sempre com supervisão da equipe mais experiente.
- Suporte na definição de métricas e painéis de QC: Apoiar a equipe na verificação da qualidade de sequências (FASTQ/BAM/VCF) e metadados clínico-fenotípicos, auxiliando no cálculo de métricas, organização de relatórios e identificação inicial de possíveis inconsistências.
- Auxílio em rotinas de automação: Contribuir para a criação e manutenção de rotinas automatizadas para ingestão e validação de dados, seguindo modelos, scripts e frameworks já utilizados pela equipe, com foco em padronização e eficiência.
- Apoio à consolidação de catálogos e metadados: Participar da organização e atualização de catálogos de variantes e metadados, ajudando em tarefas de indexação, versionamento e harmonização de informações conforme ontologias e padrões reconhecidos.
- Colaboração na elaboração de Procedimentos Operacionais Padrão (SOPs): Ajudar na preparação de documentos técnicos, guias e templates, contribuindo para a padronização e reprodutibilidade dos processos, com orientação da equipe técnica.
- Participação na documentação dos processos e pipelines: Auxiliar na criação e manutenção da documentação das soluções implementadas, garantindo clareza, organização e apoio ao trabalho da equipe, contribuindo para a rastreabilidade e evolução futura dos processos.
Requisitos
- QUALIFICAÇÕES MÍNIMAS
- Graduação completa em Bioinformática, Biologia, Biotecnologia, Computação, Engenharia Biomédica ou áreas correlatas OU especialização/mestrado em áreas relacionadas à genômica, biologia computacional ou análise de dados biomédicos.
- Experiência prévia de pelo menos 1 ano em bioinformática (projetos acadêmicos, iniciação científica, estágios, ICs, TCCs, participações em laboratórios ou grupos de pesquisa).
- Experiência básica com pipelines ou etapas bioinformáticas (pré-processamento, alinhamento, chamadas de variantes).
- Participação em projetos ou atividades envolvendo dados genômicos, exoma ou painéis — acadêmicos ou profissionais.
- Conhecimento inicial de Nextflow e/ou WDL/Cromwell, com disposição para aprofundamento e aprendizado prático.
- Familiaridade com ferramentas essenciais: BWA, samtools/bcftools, Picard, FastQC, mesmo que aplicada em contextos acadêmicos.
- Interesse e noções básicas sobre ontologias biomédicas (HPO, SNOMED, OMOP) ou metadados clínicos.
- Experiência inicial com containers (Docker ou Singularity/Apptainer).
- Noções de QC e curadoria de dados genômicos (ex.: uso de FastQC, MultiQC).
- Conhecimento básico de ambientes Linux e Shell Script.
- Familiaridade com Git e versionamento de código.
- Interesse em aprender sobre execução em HPC (SLURM, filas, quotas).
- Boa capacidade de organização e aprendizado contínuo.
- Abordagem analítica e curiosidade científica.
- Facilidade para trabalhar em equipe multidisciplinar.
- Comunicação clara e abertura para receber orientação técnica.
- QUALIFICAÇÕES PREFERENCIAIS
- Conhecimento introdutório sobre padrões GA4GH (ex.: já ter lido ou utilizado Phenopackets, DUO, htsget).
- Experiência prévia com ferramentas de coleta e organização de dados clínicos/fenotípicos (ex.: REDCap).
- Inglês básico ou intermediário para leitura de documentação técnica.
- Publicações acadêmicas, posters ou apresentações em eventos científicos.
- Participação em competições, hackathons ou cursos avançados de bioinformática.
